12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0128 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0128  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 328 aa  661    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.1714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1888  periplasmic solute binding protein  92.18 
 
 		 326 aa  551  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.447196 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1367  periplasmic solute binding protein  56.11 
 
 		 378 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.508502 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0998  periplasmic solute binding protein  62.26 
 
 		 331 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0851489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0121  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0314427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  24.51 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  24.1 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  21.63 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>