More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1535 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
299 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  74.49 
 
 
299 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  74.15 
 
 
299 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  73.24 
 
 
299 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  44.96 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  38.18 
 
 
294 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  42.07 
 
 
303 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  40.27 
 
 
303 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  40.59 
 
 
293 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  42.37 
 
 
302 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  43.73 
 
 
302 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  41.11 
 
 
302 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  41.11 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  41.11 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  41.11 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  40.15 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  40.15 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  40.15 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  40.22 
 
 
307 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  39.78 
 
 
288 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  41.64 
 
 
297 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  38.1 
 
 
315 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  38.04 
 
 
298 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  36.11 
 
 
308 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  34.62 
 
 
308 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  37.8 
 
 
292 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  34.17 
 
 
300 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  34.43 
 
 
318 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  35.87 
 
 
301 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
336 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 
308 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
278 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  32.56 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 
368 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 
310 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  26.69 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  38.52 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.7 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  21.72 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  21.72 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  26.35 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 
497 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  26.21 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  26.01 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  24.41 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.41 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  24.41 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 
494 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  24.02 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.02 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  29.69 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  28.52 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  27.2 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.02 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.97 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  26.84 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 
469 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  26.84 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.02 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  24.41 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  23.74 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  25.4 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>