More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1698 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.71 
 
 
896 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 
910 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 
858 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  52.6 
 
 
871 aa  827    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
850 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 
860 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  85.03 
 
 
882 aa  1338    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
903 aa  669    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 
854 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
860 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 
865 aa  706    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 
892 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  46.58 
 
 
868 aa  755    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 
891 aa  702    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  48.07 
 
 
898 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 
892 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 
890 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 
894 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  47.19 
 
 
932 aa  767    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
872 aa  710    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  97.17 
 
 
882 aa  1540    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.41 
 
 
897 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 
886 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  47.63 
 
 
882 aa  672    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 
864 aa  670    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
900 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 
855 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.24 
 
 
854 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 
868 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 
854 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 
892 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  51.08 
 
 
870 aa  808    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.39 
 
 
858 aa  652    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 
873 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  45.56 
 
 
869 aa  761    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  53.51 
 
 
872 aa  844    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
904 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
868 aa  654    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 
892 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  48.75 
 
 
872 aa  770    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.9 
 
 
882 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.81 
 
 
873 aa  778    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  48.2 
 
 
823 aa  696    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  46.21 
 
 
863 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
895 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
882 aa  1719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
878 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 
828 aa  641    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 
853 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
855 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.84 
 
 
862 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  48.02 
 
 
837 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44.2 
 
 
896 aa  756    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 
863 aa  710    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 
870 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
862 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 
887 aa  686    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
858 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
867 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 
869 aa  647    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  47.22 
 
 
882 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  97.28 
 
 
882 aa  1540    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.26 
 
 
872 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  48.99 
 
 
880 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
890 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 
856 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 
910 aa  701    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
910 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
871 aa  679    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
901 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
861 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
861 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 
878 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 
875 aa  691    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.08 
 
 
859 aa  725    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  49.38 
 
 
872 aa  797    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
863 aa  678    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 
892 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  46.83 
 
 
881 aa  717    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  50.73 
 
 
869 aa  830    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.63 
 
 
872 aa  645    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.51 
 
 
857 aa  685    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  50.74 
 
 
889 aa  807    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 
868 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
861 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
870 aa  803    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
872 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
855 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
887 aa  635  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  39.34 
 
 
890 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
910 aa  635  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
855 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
874 aa  632  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 
892 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 
898 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
856 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
860 aa  632  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
856 aa  632  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
856 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  46.7 
 
 
908 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>