More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3282 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1055    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.97 
 
 
533 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.38 
 
 
530 aa  349  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.43 
 
 
525 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.38 
 
 
517 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.9 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.36 
 
 
517 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.05 
 
 
521 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.58 
 
 
515 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.7 
 
 
519 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.08 
 
 
514 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  40.93 
 
 
530 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39 
 
 
524 aa  316  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.27 
 
 
524 aa  316  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  39.77 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
510 aa  310  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.77 
 
 
520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  40.62 
 
 
519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.4 
 
 
513 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.64 
 
 
524 aa  297  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.45 
 
 
521 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.69 
 
 
521 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.83 
 
 
519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.78 
 
 
509 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 
524 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.12 
 
 
524 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.08 
 
 
493 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
533 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 
511 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.33 
 
 
500 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  33.01 
 
 
511 aa  259  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
507 aa  259  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.17 
 
 
490 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.14 
 
 
498 aa  256  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 
514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35.03 
 
 
512 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.02 
 
 
498 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.83 
 
 
504 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 
492 aa  250  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  33.27 
 
 
499 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.14 
 
 
506 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.71 
 
 
528 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
501 aa  247  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
504 aa  243  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.17 
 
 
487 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  32.86 
 
 
499 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.12 
 
 
492 aa  239  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.2 
 
 
499 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.66 
 
 
511 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.68 
 
 
520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.89 
 
 
509 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.67 
 
 
496 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.92 
 
 
479 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  36.35 
 
 
488 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  36.86 
 
 
486 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.89 
 
 
501 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.73 
 
 
513 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.7 
 
 
509 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  33.21 
 
 
504 aa  227  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 
514 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.24 
 
 
501 aa  225  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  39.96 
 
 
509 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  34.72 
 
 
499 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.36 
 
 
502 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.47 
 
 
513 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.31 
 
 
512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  35.09 
 
 
512 aa  221  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.05 
 
 
533 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 
515 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 
500 aa  220  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  35.11 
 
 
510 aa  220  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  35.31 
 
 
510 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.42 
 
 
490 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.11 
 
 
515 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  35.11 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  35.11 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 
502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  35.11 
 
 
515 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  35.18 
 
 
510 aa  217  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
542 aa  216  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.91 
 
 
515 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  34.23 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  34.87 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.47 
 
 
531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.16 
 
 
531 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  34.11 
 
 
500 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.95 
 
 
501 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.91 
 
 
510 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.07 
 
 
504 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.18 
 
 
512 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.38 
 
 
556 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 
504 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.35 
 
 
514 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.35 
 
 
514 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.35 
 
 
514 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.34 
 
 
499 aa  210  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.35 
 
 
514 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  32.87 
 
 
504 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  34.95 
 
 
514 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>