More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1127 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
359 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  66.35 
 
 
318 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  54.75 
 
 
418 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  40.8 
 
 
632 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  42.69 
 
 
662 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  34.13 
 
 
423 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  33.44 
 
 
313 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.65 
 
 
313 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 
419 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
395 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
393 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
337 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.22 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
465 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
400 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 
416 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
727 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.84 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.28 
 
 
357 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
331 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.7 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
368 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.29 
 
 
405 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
342 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
335 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.33 
 
 
657 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
310 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.65 
 
 
345 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.24 
 
 
324 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  29.36 
 
 
323 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.36 
 
 
327 aa  105  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 
468 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
406 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
652 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  25.15 
 
 
416 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
373 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 
438 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
429 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
412 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
415 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.53 
 
 
406 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.06 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  30.37 
 
 
489 aa  96.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.21 
 
 
236 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.85 
 
 
312 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  34.32 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  25.72 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.69 
 
 
460 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30.69 
 
 
460 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.87 
 
 
451 aa  92.8  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  32.95 
 
 
374 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.11 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
415 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.37 
 
 
350 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  29.32 
 
 
615 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
426 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.21 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.49 
 
 
501 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.36 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.04 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.4 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  31.01 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
428 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  27.11 
 
 
417 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 
456 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.15 
 
 
418 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 
456 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3525  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.89 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124097  hitchhiker  0.00602561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>