More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2152 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
416 aa  834    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  63.73 
 
 
446 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  64.46 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  63.48 
 
 
437 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  60.49 
 
 
441 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  63.17 
 
 
439 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  62.68 
 
 
438 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  62.93 
 
 
441 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  60.69 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  58.71 
 
 
436 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  62.23 
 
 
454 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  60.78 
 
 
436 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  61.03 
 
 
438 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  58.61 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  59.09 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  59.66 
 
 
611 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  59.66 
 
 
440 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  57.89 
 
 
414 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  57.52 
 
 
416 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  55.88 
 
 
440 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  47.76 
 
 
433 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  48.22 
 
 
435 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  46.72 
 
 
463 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.51 
 
 
432 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  47.06 
 
 
433 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  40.54 
 
 
416 aa  320  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 
400 aa  309  6.999999999999999e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
399 aa  302  7.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.61 
 
 
404 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.03 
 
 
399 aa  294  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
403 aa  293  5e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
395 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  40.79 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
383 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  40.7 
 
 
417 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
401 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.29 
 
 
397 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
396 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
396 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
395 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
450 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
395 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
411 aa  276  5e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.27 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.43 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 
394 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 
401 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 
395 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
413 aa  269  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.66 
 
 
393 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 
394 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
411 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.03 
 
 
397 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
393 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.44 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.46 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 
393 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  39.58 
 
 
426 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 
393 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
393 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
426 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
393 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
393 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
401 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.3 
 
 
406 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
393 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
406 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
408 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
398 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.46 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
411 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.6 
 
 
410 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.6 
 
 
410 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
397 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 
377 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
398 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
410 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 
394 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
405 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
411 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  40.77 
 
 
402 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
411 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.53 
 
 
400 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.26 
 
 
416 aa  256  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  34.53 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>