98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2260 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 356 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  36.33 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  36.48 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  33.87 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  34.92 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  34.92 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  36.25 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  34.92 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  36.25 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  36.25 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  36.25 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  36.25 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  36.25 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  36.25 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  34.87 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  32.88 
 
 		 293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  35.1 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  35.44 
 
 		 297 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  35.81 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  32.52 
 
 		 293 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  32.89 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  31.13 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  31.58 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  30.07 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  30.24 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  30.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  30.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  30.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  30.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  30.71 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  33.2 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  30.71 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  30.59 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  32.8 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  29.51 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  27.8 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  26.1 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.37 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.83 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  24.56 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  25.79 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  25.79 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  22.31 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.45 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.83 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  26.22 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  27.62 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  25.47 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  23.05 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  25.15 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  23.47 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  23.47 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  22.18 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  22.61 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  25.23 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  25.23 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  25.23 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  23.31 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  22.64 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.24 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  21.94 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  26.9 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  23.36 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  37.93 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.89 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  22.75 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>