2255 genes were found for organism Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Coch_0001  CDS  NC_013162  728  1642  915  Luciferase-like monooxygenase  YP_003140128  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0002  CDS  NC_013162  1652  2602  951  transcriptional regulator, LysR family  YP_003140129  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0003  CDS  NC_013162  2659  4767  2109  carboxyl-terminal protease  YP_003140130  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0004  CDS  NC_013162  4987  6042  1056  hypothetical protein  YP_003140131  normal  0.326311  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0005  CDS  NC_013162  6044  6178  135  hypothetical protein  YP_003140132  normal  0.180702  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0006  CDS  NC_013162  6540  7082  543  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_003140133  normal  0.124143  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0007  CDS  NC_013162  7084  9282  2199  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_003140134  normal  0.623627  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0008  CDS  NC_013162  9313  10089  777  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_003140135  normal  0.970645  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0009  CDS  NC_013162  10141  10431  291  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_003140136  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0010  CDS  NC_013162  10584  11051  468  hypothetical protein  YP_003140137  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0011  CDS  NC_013162  11210  12190  981  hypothetical protein  YP_003140138  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0012  CDS  NC_013162  12654  13304  651  TrkA-N domain protein  YP_003140139  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0013  CDS  NC_013162  13308  14636  1329  H(+)-transporting two-sector ATPase  YP_003140140  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0014  CDS  NC_013162  14649  15518  870  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_003140141  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0015  CDS  NC_013162  15657  17126  1470  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  YP_003140142  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0016  CDS  NC_013162  17265  18812  1548  Exo-alpha-sialidase  YP_003140143  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0017  CDS  NC_013162  18890  19462  573  PhnA protein  YP_003140144  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0018  CDS  NC_013162  19578  20315  738  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  YP_003140145  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0019  CDS  NC_013162  20495  22390  1896  heat shock protein 90  YP_003140146  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0020  CDS  NC_013162  23003  25855  2853  Non-specific serine/threonine protein kinase  YP_003140147  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0021  CDS  NC_013162  25911  26198  288  hypothetical protein  YP_003140148  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0022  CDS  NC_013162  26216  26440  225  hypothetical protein  YP_003140149  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0023  CDS  NC_013162  26456  26965  510  hypothetical protein  YP_003140150  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0024  CDS  NC_013162  26973  28256  1284  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  YP_003140151  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0025  CDS  NC_013162  28358  30139  1782  cell division protein FtsZ  YP_003140152  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0026  CDS  NC_013162  30169  31596  1428  cell division protein FtsA  YP_003140153  normal  0.70753  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0027  CDS  NC_013162  31848  32585  738  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  YP_003140154  normal  0.211748  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0028  CDS  NC_013162  32588  33031  444  conserved hypothetical membrane spanning protein  YP_003140155  normal  0.0903727  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0029  CDS  NC_013162  33111  34463  1353  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_003140156  decreased coverage  0.00270537  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0030  CDS  NC_013162  34475  34978  504  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_003140157  normal  0.0146417  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0031  CDS  NC_013162  35011  36021  1011  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_003140158  normal  0.0645987  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0032  CDS  NC_013162  36948  37271  324  hypothetical protein  YP_003140159  normal  0.0128652  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0033  CDS  NC_013162  37373  49249  11877  Hyalin  YP_003140160  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0034  CDS  NC_013162  49880  50989  1110  alanine racemase  YP_003140161  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0035  CDS  NC_013162  50986  51753  768  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_003140162  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0036  CDS  NC_013162  52364  53677  1314  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  YP_003140163  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0037  CDS  NC_013162  53661  54404  744  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit E  YP_003140164  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0038  CDS  NC_013162  54425  55072  648  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  YP_003140165  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0039  CDS  NC_013162  55079  55816  738  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  YP_003140166  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0040  CDS  NC_013162  55820  57049  1230  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  YP_003140167  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0041  CDS  NC_013162  57046  57570  525  protein of unknown function DUF1706  YP_003140168  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0042  CDS  NC_013162  57576  58451  876  hypothetical protein  YP_003140169  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0043  CDS  NC_013162  58492  59847  1356  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  YP_003140170  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0044  CDS  NC_013162  60211  60663  453  hypothetical protein  YP_003140171  normal  0.624797  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0045  CDS  NC_013162  60660  61232  573  hypothetical protein  YP_003140172  normal  0.720292  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0046  CDS  NC_013162  61222  61617  396  hypothetical protein  YP_003140173  normal  0.609382  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0047  CDS  NC_013162  61663  62064  402  hypothetical protein  YP_003140174  normal  0.60484  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0048    NC_013162  62077  63174  1098      normal  0.108456  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0049  CDS  NC_013162  63177  63629  453  hypothetical protein  YP_003140175  normal  0.0865482  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0050  CDS  NC_013162  63626  64195  570  hypothetical protein  YP_003140176  normal  0.102205  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0051  CDS  NC_013162  64185  64595  411  hypothetical protein  YP_003140177  decreased coverage  0.00971016  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0052  CDS  NC_013162  64616  64987  372  hypothetical protein  YP_003140178  normal  0.113235  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0053  CDS  NC_013162  64990  71217  6228  YD repeat protein  YP_003140179  normal  0.192291  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0054  CDS  NC_013162  71272  71718  447  hypothetical protein  YP_003140180  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0055  CDS  NC_013162  72152  72823  672  GTP cyclohydrolase I  YP_003140181  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0056  CDS  NC_013162  72861  75338  2478  ATP-dependent protease La  YP_003140182  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0057  CDS  NC_013162  75907  77169  1263  acetyl-CoA hydrolase/transferase  YP_003140183  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0058  CDS  NC_013162  77284  77694  411  protein of unknown function DUF1094  YP_003140184  normal  0.231212  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0059  CDS  NC_013162  77753  78904  1152  beta-lactamase  YP_003140185  normal  0.0476107  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0060  CDS  NC_013162  78921  79796  876  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  YP_003140186  hitchhiker  0.000772575  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0061  CDS  NC_013162  80011  81627  1617  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  YP_003140187  unclonable  3.29642e-07  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0062  CDS  NC_013162  81664  82662  999  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  YP_003140188  decreased coverage  5.33837e-05  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0063  CDS  NC_013162  83219  85558  2340  Beta-N-acetylhexosaminidase  YP_003140189  normal  0.0268197  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0064  CDS  NC_013162  85616  86560  945  GSCFA domain protein  YP_003140190  hitchhiker  0.00472332  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0065  CDS  NC_013162  86574  87098  525  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  YP_003140191  normal  0.0524704  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0066  CDS  NC_013162  87055  89850  2796  AsmA family protein  YP_003140192  normal  0.255308  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0067  CDS  NC_013162  89875  90294  420  3-dehydroquinate dehydratase, type II  YP_003140193  normal  0.463951  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0068  CDS  NC_013162  90302  91021  720  conserved hypothetical protein, secreted  YP_003140194  normal  0.714566  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0069  CDS  NC_013162  91031  92068  1038  glycosyl transferase family 9  YP_003140195  normal  0.960845  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0070  CDS  NC_013162  92298  93638  1341  hypothetical protein  YP_003140196  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0071  CDS  NC_013162  93906  96413  2508  glycoside hydrolase family protein  YP_003140197  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0072  CDS  NC_013162  96456  97421  966  hypothetical protein  YP_003140198  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0073  CDS  NC_013162  97549  97893  345  LrgA family protein  YP_003140199  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0074  CDS  NC_013162  97893  98585  693  LrgB family protein  YP_003140200  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0075  CDS  NC_013162  98742  99089  348  50S ribosomal protein L19  YP_003140201  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0076  CDS  NC_013162  99189  100517  1329  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_003140202  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0077  CDS  NC_013162  100510  100983  474  hypothetical protein  YP_003140203  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0078  CDS  NC_013162  100957  102108  1152  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  YP_003140204  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0079  CDS  NC_013162  102122  102667  546  Holliday junction resolvase  YP_003140205  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0080  CDS  NC_013162  102681  103214  534  hypothetical protein  YP_003140206  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0081  CDS  NC_013162  103383  104075  693  peptidase E  YP_003140207  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0082  CDS  NC_013162  104165  104326  162  hypothetical protein  YP_003140208  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0083  CDS  NC_013162  104878  105777  900  hypothetical protein  YP_003140209  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0084  CDS  NC_013162  105789  106079  291  hypothetical protein  YP_003140210  normal  0.314565  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0085  CDS  NC_013162  106076  106738  663  hypothetical protein  YP_003140211  normal  0.0719573  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0086  CDS  NC_013162  106725  108035  1311  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_003140212  normal  0.310031  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0087  CDS  NC_013162  108096  109265  1170  aminotransferase class I and II  YP_003140213  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0088  CDS  NC_013162  109349  110584  1236  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_003140214  normal  0.930587  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0089  CDS  NC_013162  110618  111316  699  hypothetical protein  YP_003140215  normal  0.813046  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0090  CDS  NC_013162  111585  112523  939  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_003140216  normal  0.376959  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0091  CDS  NC_013162  112513  113412  900  Ion transport protein  YP_003140217  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0092  CDS  NC_013162  113416  114162  747  phospholipase/Carboxylesterase  YP_003140218  normal  0.898581  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0093  CDS  NC_013162  114152  115408  1257  dihydroorotase  YP_003140219  normal  0.351912  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0094  CDS  NC_013162  115751  116263  513  NUDIX hydrolase  YP_003140220  normal  0.126747  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0095  CDS  NC_013162  116395  117879  1485  glycosyl transferase family 2  YP_003140221  normal  0.176574  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0096  CDS  NC_013162  117979  118323  345  protein of unknown function DUF419  YP_003140222  normal  0.503641  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0097  CDS  NC_013162  118336  118755  420  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_003140223  normal  0.530776  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0098  CDS  NC_013162  118759  119700  942  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_003140224  normal  0.718222  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0099  CDS  NC_013162  119780  120871  1092  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_003140225  normal  0.76867  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0100  CDS  NC_013162  121122  121871  750  triosephosphate isomerase  YP_003140226  normal  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>