More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0075 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06780  putative 50S ribosomal protein  80 
 
 		 118 aa  192  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2182  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 		 116 aa  186  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.47 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  55.67 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  54 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  46.96 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  52.83 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  53 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  47.79 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  51.82 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  54.46 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 117 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1331  ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  115  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  46.02 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  53.47 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  53.47 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  46.02 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  51.43 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  48.7 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  49.58 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  53.54 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  50 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  44.25 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  53.54 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  53.54 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  52.29 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl539  50S ribosomal protein L19  51.38 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  47.79 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  51.04 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  51.04 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  53 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  49.5 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  52.48 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  52.48 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  47.79 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  51.49 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  53.47 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  51.52 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  54.46 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>