72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0039 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0039  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  50.6 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.52 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  28.22 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14610  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.09 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  26.75 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  29.96 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1597  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.14 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000998757  normal  0.0301859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 202 aa  85.9  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.81 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2162  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.67 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25320  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.19 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0813  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.56 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.31 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.49 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.82 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.87 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.87 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0590334  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  24.32 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  29.64 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.566185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.34 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0376785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.2 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.2 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.2 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3315  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.2 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000493084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  24.54 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3615  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.57 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.2 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.2 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1575  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.75 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.46 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3403  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.14 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0605774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.94 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.94 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1882  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.45 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.09 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.88 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00248984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.36 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3436  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.84 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0636806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3364  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.84 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.84 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.14939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.84 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.24 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0984  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.53 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000820153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  24.14 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  24.15 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.56 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.77 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.36 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0955  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.52 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3101  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.51 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.48 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.85 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1082  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.57 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3580  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.11 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.88 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  30.66 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1713  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  24.25 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331936  normal  0.0300311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.3 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.48 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0946412  normal  0.964956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.03 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.079806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  22.99 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2387  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.72 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3415  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324486  normal  0.468365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  23.36 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.5 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  28.8 
 
 		 201 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>