21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0064 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  100 
 
 		 314 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  49.06 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  40.76 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  36.42 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  34.88 
 
 		 360 aa  222  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  38.8 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  37.11 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  34.94 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  25.96 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  23.56 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  24.14 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  26.16 
 
 		 590 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  22.95 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  23.64 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  23.31 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  25.59 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  23.58 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  21.61 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  24.39 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  23.84 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  23.91 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>