30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4934 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  100 
 
 		 333 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  43.12 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  39.06 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  35.48 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  37.54 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  34.94 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  31.94 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  32.7 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  20.96 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  25.84 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  23.78 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  22.97 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  23.79 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  23.08 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  23.45 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  23.62 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  26.07 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  26.12 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  21.88 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  25.42 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  25.88 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  22.18 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  23.83 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  22.55 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  22.26 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  28.66 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  21.77 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.14 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>