27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2931 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  100 
 
 		 326 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  38.17 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  35.39 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  36.42 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  35.94 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  35.11 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  37.54 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  34.24 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  23.67 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  22.87 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  21.9 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  24.19 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  22.81 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  23.44 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  23.26 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  25.45 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  24.15 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  25.49 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  23.64 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  23.62 
 
 		 575 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  24.31 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  24.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  22.46 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  22.79 
 
 		 594 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  23.42 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  25.57 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  23.31 
 
 		 587 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>