30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2100 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  748    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  48.7 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  47.88 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  47.83 
 
 		 357 aa  302  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  48.45 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  45.73 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  48.56 
 
 		 367 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  44.3 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  44.9 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  43.79 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  43.43 
 
 		 353 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  42.78 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  42.9 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  42.41 
 
 		 353 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  36.11 
 
 		 594 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  34.92 
 
 		 587 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  34.26 
 
 		 590 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  34.09 
 
 		 575 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  30.9 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  29.75 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  34.39 
 
 		 311 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  25.09 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  24.75 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  23.45 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  22.87 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  22.18 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  24.86 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  24.24 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.33 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  24.39 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>