25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0285 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  29.79 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  25.17 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  24.57 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  24.57 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  24.21 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  24.49 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  25.25 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  29.3 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  28.02 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  26.62 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  31.5 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  30.08 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  23.79 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  27.92 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  24.01 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  24.7 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  24.7 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  26.29 
 
 		 590 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  23.45 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  25.5 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  24.36 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  24.7 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  20.58 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  24.14 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>