25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1897 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  49.06 
 
 		 314 aa  322  6e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  48.28 
 
 		 315 aa  318  5e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  38.17 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  38.92 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  35.48 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  33 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  35.51 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  24.1 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  26.37 
 
 		 587 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  24.83 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  23.78 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  21.92 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  19.03 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  21.23 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  19.6 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  20.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  19.59 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  32.43 
 
 		 533 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  24.24 
 
 		 373 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  24.14 
 
 		 590 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  19.52 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  23.02 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  21.25 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  19.93 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>