29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2594 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  38.94 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  39.06 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  38.92 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  38.8 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  38.31 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  35.11 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  32.53 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  31.8 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  25.09 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  24.04 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  25.56 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  26.16 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  23.53 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  24.81 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  24.71 
 
 		 575 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  24.05 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  23.81 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  26.55 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  23.86 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  25 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  24.64 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  23.32 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  23.4 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  23.67 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  22.43 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  23.19 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  24.31 
 
 		 533 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  25.86 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>