30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1589 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  54.16 
 
 		 587 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1238    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  68.93 
 
 		 594 aa  870    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  44.86 
 
 		 575 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  36.65 
 
 		 346 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  38.91 
 
 		 363 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  35.87 
 
 		 398 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  35.87 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  34.18 
 
 		 359 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  34.86 
 
 		 353 aa  193  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  34.26 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  33.62 
 
 		 350 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  34.19 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  34.19 
 
 		 353 aa  183  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  35.13 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  34.08 
 
 		 357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  33.62 
 
 		 355 aa  173  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  34.84 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  28.04 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  29.64 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  26.22 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  25.56 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  31.17 
 
 		 311 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  27.72 
 
 		 338 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  26.29 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25.35 
 
 		 315 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  25.84 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  25.49 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  24.14 
 
 		 319 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  26.16 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>