30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5393 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  89.49 
 
 		 353 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  100 
 
 		 353 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  89.49 
 
 		 353 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  65.83 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  67.24 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  53.39 
 
 		 398 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  52.82 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  53.04 
 
 		 359 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  47.66 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  42.05 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  43.58 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  40.69 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  43.43 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  42.68 
 
 		 357 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  34.36 
 
 		 594 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  34.86 
 
 		 590 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  31.01 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  31.25 
 
 		 575 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  32.45 
 
 		 453 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  28.57 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.85 
 
 		 533 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.57 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  25.59 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  23.45 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  25.45 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  23.19 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25.81 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  23.1 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  32.14 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  19.52 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>