29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4935 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  804    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  29.82 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  29.79 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  30.56 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  29.64 
 
 		 453 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  29.35 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  28.94 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  28.32 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  27.61 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  29.26 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  27.13 
 
 		 575 aa  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  27.37 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  27.99 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  26.58 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  30.17 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  26.6 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  26.22 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  26.67 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  27.47 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  30 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  25.59 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  26.65 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  28.62 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  26.07 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25.58 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  23.56 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  24.89 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  25.86 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  23.02 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>