31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1449 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1226    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  54.16 
 
 		 590 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  54.76 
 
 		 594 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  43.8 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  36.24 
 
 		 346 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  38.48 
 
 		 352 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  34.92 
 
 		 373 aa  194  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  33.54 
 
 		 359 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  32.86 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  30.42 
 
 		 353 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  31.01 
 
 		 353 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  30.14 
 
 		 353 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  32.6 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  32.33 
 
 		 398 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  31.93 
 
 		 355 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  34.19 
 
 		 363 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  34.84 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  29.6 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.62 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  25.25 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  25.16 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  26.88 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  25.18 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  24.04 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  26.37 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  23.62 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25.69 
 
 		 315 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  24.52 
 
 		 314 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.31 
 
 		 326 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  23.33 
 
 		 360 aa  43.5  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>