32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2811 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  49.58 
 
 
350 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  49.31 
 
 
353 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  48.75 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  48.89 
 
 
353 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  47.92 
 
 
398 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  48.2 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  48.06 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  47.78 
 
 
355 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  46.31 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  44.14 
 
 
346 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  42.45 
 
 
352 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  41.67 
 
 
373 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  40.11 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  35.99 
 
 
590 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  33.06 
 
 
594 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  33.7 
 
 
575 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  31.68 
 
 
587 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  33.11 
 
 
453 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  27.89 
 
 
311 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  27.65 
 
 
386 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  25.93 
 
 
533 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  23.88 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  21.02 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.32 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  23.86 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1244  hypothetical protein  65.22 
 
 
64 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.57 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  21.09 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1469  hypothetical protein  59.09 
 
 
58 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.388803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  20 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1439  hypothetical protein  44.62 
 
 
104 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>