28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2272 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  48.7 
 
 		 373 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  45.76 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  45.48 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  43.71 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  42.07 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  42.05 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  42.17 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  44.13 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  43.49 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  40.92 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  38.57 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  40.06 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  43.55 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  39.13 
 
 		 575 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  36.24 
 
 		 587 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  36.75 
 
 		 594 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  36.65 
 
 		 590 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  30.31 
 
 		 453 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  28.32 
 
 		 386 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  28.89 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  29.04 
 
 		 533 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  26.92 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  25.96 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  31.5 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  23.81 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  24.31 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  21.13 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>