30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3095 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  68.93 
 
 		 590 aa  870    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  54.76 
 
 		 587 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1244    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  43.49 
 
 		 575 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  36.11 
 
 		 373 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  36.75 
 
 		 346 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  34.34 
 
 		 359 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  36.26 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  35.71 
 
 		 398 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  33.98 
 
 		 353 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  34.36 
 
 		 353 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  37.66 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  33.61 
 
 		 353 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  34.29 
 
 		 363 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  36.08 
 
 		 367 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  31.52 
 
 		 350 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  30.92 
 
 		 357 aa  173  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  32.29 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  27.64 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.64 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  31.8 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  27.99 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  28.02 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  32.92 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  26.49 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  26.12 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  23.78 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  26.71 
 
 		 315 aa  53.9  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  22.79 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  25.59 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>