30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2652 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  97.49 
 
 		 398 aa  763    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  801    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  54.39 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  54.19 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  52.82 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  52.26 
 
 		 353 aa  342  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  51.98 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  48.59 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  50.63 
 
 		 363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  50.32 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  42.45 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  44.9 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  40.06 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  40.7 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  36.26 
 
 		 594 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  35.87 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  34.08 
 
 		 575 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  32.33 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  32.14 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  27.66 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  29.26 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.7 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  27.57 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.44 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  23.49 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  24.64 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  22.45 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  23.31 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  20.64 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>