13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0011 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  673    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  59.81 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  47.65 
 
 		 391 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  47.14 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  46.89 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0094  hypothetical protein  36.99 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  29.97 
 
 		 427 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  26.43 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1585  hypothetical protein  26.64 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3427  hypothetical protein  23.27 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0444  hypothetical protein  25.43 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>