849 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rsph17025_3140  CDS  NC_009429  230  1681  +  1452  hypothetical protein  YP_001169329  normal  0.673481  normal  0.234219  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3141  CDS  NC_009429  1862  2695  +  834  hypothetical protein  YP_001169330  normal  1  normal  0.122231  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3142  CDS  NC_009429  2928  4130  +  1203  hypothetical protein  YP_001169331  normal  0.856051  normal  0.126426  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3143  CDS  NC_009429  4142  4396  -  255  hypothetical protein  YP_001169332  normal  0.28458  normal  0.096168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3144  CDS  NC_009429  4454  5635  -  1182  hypothetical protein  YP_001169333  normal  0.0744058  normal  0.288256  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3145  CDS  NC_009429  5781  6221  -  441  3-dehydroquinate dehydratase  YP_001169334  normal  0.35351  normal  0.502836  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3146  CDS  NC_009429  6336  8471  -  2136  hypothetical protein  YP_001169335  normal  1  normal  0.475632  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3147  CDS  NC_009429  8475  8933  -  459  hypothetical protein  YP_001169336  normal  1  normal  0.483124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3148  CDS  NC_009429  9065  9511  -  447  hypothetical protein  YP_001169337  normal  1  normal  0.486705  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3149  CDS  NC_009429  9600  10223  -  624  aldose 1-epimerase  YP_001169338  normal  1  normal  0.491093  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3150  CDS  NC_009429  10409  11392  -  984  hypothetical protein  YP_001169339  normal  1  normal  0.516147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3151  CDS  NC_009429  11441  12451  -  1011  hypothetical protein  YP_001169340  normal  1  normal  0.506548  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3152  CDS  NC_009429  12523  13014  +  492  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  YP_001169341  normal  1  normal  0.459101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3153  CDS  NC_009429  13011  13745  +  735  hypothetical protein  YP_001169342  normal  1  normal  0.641023  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3154  CDS  NC_009429  13738  14520  +  783  hypothetical protein  YP_001169343  normal  1  normal  0.87263  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3155  CDS  NC_009429  14765  17260  +  2496  hypothetical protein  YP_001169344  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3156  CDS  NC_009429  17350  18141  -  792  hypothetical protein  YP_001169345  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3157  CDS  NC_009429  18615  18980  +  366  hypothetical protein  YP_001169346  normal  1  normal  0.97591  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3158  CDS  NC_009429  19296  20051  +  756  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  YP_001169347  normal  1  normal  0.797514  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3159  CDS  NC_009429  20048  21142  +  1095  hypothetical protein  YP_001169348  normal  0.600776  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3160  CDS  NC_009429  21201  22919  +  1719  hypothetical protein  YP_001169349  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3161  CDS  NC_009429  22912  23988  +  1077  hypothetical protein  YP_001169350  normal  0.260707  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3162  CDS  NC_009429  23990  25177  +  1188  Citryl-CoA lyase  YP_001169351  normal  0.33357  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3163  CDS  NC_009429  25174  26016  +  843  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_001169352  normal  0.517185  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3164  CDS  NC_009429  26013  27017  +  1005  dimethylmenaquinone methyltransferase  YP_001169353  normal  0.608569  normal  0.589284  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3165  CDS  NC_009429  27029  27706  +  678  hypothetical protein  YP_001169354  normal  0.25915  normal  0.552325  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3166  CDS  NC_009429  27840  29213  -  1374  hypothetical protein  YP_001169355  normal  1  normal  0.861673  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3167  CDS  NC_009429  29230  30723  -  1494  hypothetical protein  YP_001169356  normal  0.662666  normal  0.634787  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3168  CDS  NC_009429  30839  31315  -  477  hypothetical protein  YP_001169357  normal  0.254618  normal  0.523105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3169  CDS  NC_009429  31374  32759  +  1386  hypothetical protein  YP_001169358  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3170  CDS  NC_009429  32868  33653  +  786  hypothetical protein  YP_001169359  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3171  CDS  NC_009429  33682  34500  +  819  hypothetical protein  YP_001169360  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3172  CDS  NC_009429  34561  35217  +  657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001169361  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3173  CDS  NC_009429  35217  35876  +  660  Asp/Glu racemase  YP_001169362  normal  0.471427  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3174  CDS  NC_009429  35873  36637  +  765  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_001169363  normal  0.20546  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3175  CDS  NC_009429  36634  37590  +  957  threonine dehydratase  YP_001169364  normal  0.465407  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3176  CDS  NC_009429  37587  38570  +  984  ectoine utilization protein EutC  YP_001169365  normal  0.301146  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3177  CDS  NC_009429  38613  39794  +  1182  hypothetical protein  YP_001169366  normal  0.266675  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3178  CDS  NC_009429  39799  40806  +  1008  hypothetical protein  YP_001169367  normal  0.860392  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3179  CDS  NC_009429  40968  41651  -  684  hypothetical protein  YP_001169368  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3180  CDS  NC_009429  41727  42647  +  921  hypothetical protein  YP_001169369  normal  1  normal  0.858201  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3181  CDS  NC_009429  42796  44898  +  2103  hypothetical protein  YP_001169370  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3182  CDS  NC_009429  44971  45252  +  282  hypothetical protein  YP_001169371  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3183  CDS  NC_009429  45381  45914  +  534  hypothetical protein  YP_001169372  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3184  CDS  NC_009429  46122  48032  +  1911  hypothetical protein  YP_001169373  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3185  CDS  NC_009429  48198  49781  -  1584  glucan biosynthesis protein D  YP_001169374  normal  0.657429  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3186  CDS  NC_009429  50017  50559  -  543  hypothetical protein  YP_001169375  normal  0.155637  normal  0.897165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3187  CDS  NC_009429  50650  51747  -  1098  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  YP_001169376  normal  0.600776  normal  0.981913  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3188  CDS  NC_009429  51744  52238  -  495  ferredoxin  YP_001169377  normal  1  normal  0.888796  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3189  CDS  NC_009429  52244  52441  -  198  hypothetical protein  YP_001169378  normal  0.690909  normal  0.847621  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3190  CDS  NC_009429  52496  52783  -  288  hypothetical protein  YP_001169379  normal  1  normal  0.840017  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3191  CDS  NC_009429  52801  54096  -  1296  hypothetical protein  YP_001169380  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3192  CDS  NC_009429  54459  55040  +  582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit E  YP_001169381  normal  0.150782  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3193  CDS  NC_009429  55056  55622  +  567  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  YP_001169382  normal  0.0473015  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3194  CDS  NC_009429  55619  57178  +  1560  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  YP_001169383  normal  0.0106168  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3195  CDS  NC_009429  57175  58257  +  1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  YP_001169384  normal  0.176851  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3196  CDS  NC_009429  58254  58916  +  663  RnfA-Nqr electron transport subunit  YP_001169385  normal  0.401599  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3197  CDS  NC_009429  58931  59665  +  735  electron transport complex RsxE subunit  YP_001169386  normal  0.113387  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3198  CDS  NC_009429  59662  59919  +  258  hypothetical protein  YP_001169387  normal  0.180985  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3199  CDS  NC_009429  59968  60984  +  1017  hypothetical protein  YP_001169388  normal  0.539109  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3200  CDS  NC_009429  61037  61603  +  567  hypothetical protein  YP_001169389  normal  1  normal  0.921253  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3201  CDS  NC_009429  61616  62338  +  723  hypothetical protein  YP_001169390  normal  1  normal  0.714727  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3202  CDS  NC_009429  62335  63219  -  885  hypothetical protein  YP_001169391  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3203  CDS  NC_009429  63212  64009  -  798  hypothetical protein  YP_001169392  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3204  CDS  NC_009429  64139  64660  +  522  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  YP_001169393  normal  1  normal  0.880505  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3205  CDS  NC_009429  64657  65640  +  984  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead  YP_001169394  normal  1  normal  0.985518  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3206  CDS  NC_009429  65637  67853  +  2217  hypothetical protein  YP_001169395  normal  0.799224  normal  0.954215  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3207  CDS  NC_009429  68054  70090  -  2037  hypothetical protein  YP_001169396  normal  1  normal  0.519422  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3208  CDS  NC_009429  70443  71603  +  1161  hypothetical protein  YP_001169397  normal  1  normal  0.302863  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3209  CDS  NC_009429  71617  72723  -  1107  hypothetical protein  YP_001169398  normal  1  normal  0.312893  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3210  CDS  NC_009429  72871  73422  -  552  hypothetical protein  YP_001169399  normal  1  normal  0.743942  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3211  CDS  NC_009429  73519  73719  -  201  hypothetical protein  YP_001169400  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3212  CDS  NC_009429  73805  74827  -  1023  hypothetical protein  YP_001169401  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3213  CDS  NC_009429  74946  75638  -  693  NAD-dependent deacetylase  YP_001169402  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3214  CDS  NC_009429  75699  77321  -  1623  ABC-2 type transporter  YP_001169403  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3215  CDS  NC_009429  77399  78523  -  1125  hypothetical protein  YP_001169404  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3216  CDS  NC_009429  78525  81230  -  2706  hypothetical protein  YP_001169405  normal  0.881603  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3217  CDS  NC_009429  81234  82229  -  996  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  YP_001169406  normal  0.717243  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3218  CDS  NC_009429  82520  83224  -  705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001169407  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3219  CDS  NC_009429  83237  83683  -  447  polyferredoxin-like protein  YP_001169408  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3220  CDS  NC_009429  83701  84609  -  909  quinol dehydrogenase membrane component  YP_001169409  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3221  CDS  NC_009429  84606  85397  -  792  hypothetical protein  YP_001169410  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3222  CDS  NC_009429  85399  87885  -  2487  nitrate reductase catalytic subunit  YP_001169411  normal  0.497822  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3223  CDS  NC_009429  87899  88153  -  255  hypothetical protein  YP_001169412  normal  1  normal  0.957908  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3224  CDS  NC_009429  88147  88638  -  492  hypothetical protein  YP_001169413  normal  1  normal  0.998418  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3225  CDS  NC_009429  88850  89956  -  1107  hypothetical protein  YP_001169414  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3226  CDS  NC_009429  89987  92077  -  2091  bacterioferritin  YP_001169415  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3227  CDS  NC_009429  92467  92964  -  498  hypothetical protein  YP_001169416  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3228  CDS  NC_009429  93330  94283  +  954  hypothetical protein  YP_001169417  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3229  CDS  NC_009429  94280  94714  -  435  hypothetical protein  YP_001169418  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3230  CDS  NC_009429  94866  95564  -  699  hypothetical protein  YP_001169419  normal  1  normal  0.760608  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3231  CDS  NC_009429  95687  95902  +  216  hypothetical protein  YP_001169420  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3232  CDS  NC_009429  96070  96747  +  678  protein tyrosine phosphatase  YP_001169421  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3233  CDS  NC_009429  96855  97328  +  474  hypothetical protein  YP_001169422  normal  1  normal  0.712863  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3234  CDS  NC_009429  97341  98846  -  1506  hypothetical protein  YP_001169423  normal  1  normal  0.851144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3235  CDS  NC_009429  99036  99863  -  828  hypothetical protein  YP_001169424  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3236  CDS  NC_009429  100237  100515  -  279  hypothetical protein  YP_001169425  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3237  CDS  NC_009429  100573  101358  -  786  hypothetical protein  YP_001169426  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3238  CDS  NC_009429  101442  102032  +  591  hypothetical protein  YP_001169427  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3239  CDS  NC_009429  102538  104547  +  2010  hypothetical protein  YP_001169428  normal  0.983308  normal  0.678486  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>