16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3223 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3223  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  50 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  39.24 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  38.67 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  37.66 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4010  periplasmic nitrate reductase subunit NapD  28.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  37.66 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  32.47 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3516  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  31.51 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.107593  hitchhiker  0.00119536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  31.08 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  31.94 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>