More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3184 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1198  cadmium-translocating P-type ATPase  64.15 
 
 
646 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.08554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0127  heavy metal translocating P-type ATPase  80.79 
 
 
647 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  65.88 
 
 
665 aa  715    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.381372  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1476  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  80.79 
 
 
647 aa  907    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1100  cadmium-translocating P-type ATPase  64.31 
 
 
646 aa  697    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3297  heavy metal translocating P-type ATPase  67.89 
 
 
646 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00745206  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3184  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1232    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 
640 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
640 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
723 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.21 
 
 
641 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 
712 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 
647 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.22 
 
 
712 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.77 
 
 
724 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
712 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.26 
 
 
641 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  37.8 
 
 
641 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.26 
 
 
641 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.26 
 
 
641 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  39.33 
 
 
641 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  37.8 
 
 
641 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 
639 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  39.26 
 
 
641 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
641 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.26 
 
 
641 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
665 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
665 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
665 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
665 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  39.06 
 
 
641 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
744 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  42.4 
 
 
712 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  43.2 
 
 
635 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 
873 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
833 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.13 
 
 
834 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
826 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
677 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
880 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  39.42 
 
 
675 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
822 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
835 aa  389  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
783 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
778 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.12 
 
 
713 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
806 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
711 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.31 
 
 
814 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
740 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
851 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
850 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
869 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
851 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 
737 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
851 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 
673 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.69 
 
 
709 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  41.17 
 
 
707 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  41.07 
 
 
842 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.89 
 
 
735 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
870 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
809 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.97 
 
 
833 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
720 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
681 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  41.53 
 
 
793 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
861 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
844 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  42.26 
 
 
852 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
713 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
835 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
939 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
704 aa  369  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
709 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
904 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
718 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 
726 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
830 aa  360  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
751 aa  360  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  36.22 
 
 
788 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  36.05 
 
 
788 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  36.05 
 
 
788 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  36.05 
 
 
788 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  40.61 
 
 
764 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  36.4 
 
 
785 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  36.74 
 
 
788 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  35.88 
 
 
788 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
984 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
984 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  36.57 
 
 
788 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  36.57 
 
 
788 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  36.57 
 
 
788 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
731 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 
799 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  37.32 
 
 
799 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
712 aa  349  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  38.88 
 
 
678 aa  349  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>