More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2145 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  65.05 
 
 
822 aa  1039    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
861 aa  836    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  67.57 
 
 
665 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  54.64 
 
 
869 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  67.83 
 
 
829 aa  1026    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  55.23 
 
 
852 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  69.25 
 
 
809 aa  1092    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  67.57 
 
 
665 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  67.87 
 
 
835 aa  1073    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
826 aa  1637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  56.05 
 
 
880 aa  867    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  65.71 
 
 
853 aa  977    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  69.85 
 
 
806 aa  1059    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  67.83 
 
 
829 aa  1026    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  69.6 
 
 
830 aa  1081    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  54.49 
 
 
873 aa  836    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  65.83 
 
 
853 aa  981    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  68.52 
 
 
833 aa  1072    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  70.05 
 
 
842 aa  1089    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  67.94 
 
 
835 aa  1065    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  67.57 
 
 
665 aa  860    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  55.86 
 
 
851 aa  784    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  67.57 
 
 
665 aa  860    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  54.42 
 
 
850 aa  861    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  55.42 
 
 
870 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  68.3 
 
 
834 aa  1061    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  59.3 
 
 
677 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
851 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  54.64 
 
 
851 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 
681 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
783 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 
712 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.55 
 
 
712 aa  486  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 
712 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.82 
 
 
709 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 
707 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  41 
 
 
713 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
767 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.68 
 
 
735 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
723 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
641 aa  452  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
833 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
675 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  38.72 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
640 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.04 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  38.72 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.04 
 
 
641 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
673 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
641 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 
737 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  38.41 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  38.57 
 
 
641 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  38.63 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  39.35 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  38.72 
 
 
641 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  42.7 
 
 
724 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
868 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  39.54 
 
 
647 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
639 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
726 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
984 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
793 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
778 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
984 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
939 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 
1022 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
635 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
751 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
740 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
654 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  36.63 
 
 
752 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
800 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  39.48 
 
 
748 aa  412  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
637 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
800 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
800 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  37.95 
 
 
720 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
799 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
904 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
731 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
712 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
750 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  37.82 
 
 
712 aa  405  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
710 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
710 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
812 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
651 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
785 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
800 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
800 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
651 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 
750 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.99 
 
 
750 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.26 
 
 
752 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
655 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
734 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>