More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0485 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  55.54 
 
 
830 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
681 aa  1347    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  55.41 
 
 
835 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  54.15 
 
 
809 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  55.67 
 
 
834 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  55.36 
 
 
851 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  56.67 
 
 
869 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  55.26 
 
 
852 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  55.36 
 
 
851 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  54.97 
 
 
870 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 
826 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  54.6 
 
 
835 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  52.4 
 
 
822 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  53.77 
 
 
873 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  54.94 
 
 
842 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  54.77 
 
 
806 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  54.27 
 
 
665 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  54.27 
 
 
665 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  54.41 
 
 
833 aa  609  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  54.27 
 
 
665 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  49.63 
 
 
677 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  54.27 
 
 
665 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  52.41 
 
 
851 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  51.95 
 
 
861 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  52.37 
 
 
880 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  56.8 
 
 
829 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  56.8 
 
 
829 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  49.17 
 
 
850 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  53 
 
 
853 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  52.85 
 
 
853 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 
783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
707 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
767 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.62 
 
 
712 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  39.32 
 
 
713 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
712 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
712 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.52 
 
 
833 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.38 
 
 
735 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
723 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
641 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
675 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.17 
 
 
709 aa  412  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  38.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  38.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  38.13 
 
 
641 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  38.38 
 
 
641 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  37.94 
 
 
641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  38.13 
 
 
641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  38.1 
 
 
641 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
799 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  37.94 
 
 
641 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.94 
 
 
726 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  37.83 
 
 
641 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  40.18 
 
 
724 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
752 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
800 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
750 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
793 aa  399  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
654 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
800 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
800 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  37.92 
 
 
800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  37.92 
 
 
800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
656 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
635 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.4 
 
 
673 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
984 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 
778 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
984 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
737 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
641 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
712 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  39.26 
 
 
718 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
799 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  37.72 
 
 
750 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
868 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
740 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  38.31 
 
 
799 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  37.93 
 
 
794 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
750 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
651 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  37.86 
 
 
757 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  38.51 
 
 
655 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 
752 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  39.94 
 
 
712 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
728 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
825 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
750 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
728 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
639 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
647 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
646 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
769 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  37.03 
 
 
801 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
791 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
655 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.52 
 
 
656 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>