More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2582 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 
665 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  68.34 
 
 
834 aa  1076    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 
665 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  60.87 
 
 
677 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  59.33 
 
 
869 aa  807    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  66.95 
 
 
829 aa  1016    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  65.99 
 
 
853 aa  994    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  68.96 
 
 
835 aa  1077    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  71.22 
 
 
806 aa  1109    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  59.18 
 
 
870 aa  807    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  55.69 
 
 
681 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  58.46 
 
 
861 aa  885    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  69.01 
 
 
826 aa  1088    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  55.42 
 
 
850 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  65.87 
 
 
853 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  66.95 
 
 
829 aa  1016    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 
665 aa  877    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
830 aa  1644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  59.86 
 
 
880 aa  929    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  68.5 
 
 
833 aa  1081    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  59.33 
 
 
851 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  59.83 
 
 
852 aa  824    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  62.95 
 
 
822 aa  1004    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  58.53 
 
 
851 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 
665 aa  877    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  68.93 
 
 
835 aa  1102    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  70.74 
 
 
809 aa  1115    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  70.39 
 
 
842 aa  1098    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  59.45 
 
 
851 aa  809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  59.25 
 
 
873 aa  901    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
783 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.13 
 
 
712 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  43.09 
 
 
712 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
712 aa  482  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.35 
 
 
713 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.37 
 
 
709 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  43.5 
 
 
723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
707 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.09 
 
 
767 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  42.34 
 
 
735 aa  465  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
675 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
640 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
724 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.47 
 
 
641 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.47 
 
 
641 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.47 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
639 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
641 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.31 
 
 
641 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.15 
 
 
641 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
641 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  39.47 
 
 
641 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.15 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  39.31 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
833 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 
673 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 
984 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 
984 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
793 aa  438  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  39.47 
 
 
641 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
778 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
637 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
1022 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
802 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 
939 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
751 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  43.17 
 
 
635 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
734 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
651 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
641 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
800 aa  426  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  42.2 
 
 
799 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
800 aa  426  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 
734 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
712 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 
737 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
718 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
800 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
791 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  41.42 
 
 
750 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
750 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
868 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
726 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
750 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
800 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
800 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
750 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  37.06 
 
 
812 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
709 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.95 
 
 
742 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
701 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
744 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
728 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  40.72 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  37.4 
 
 
726 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
728 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
734 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
972 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>