More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2806 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  69.3 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  69.18 
 
 
834 aa  1081    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  70.37 
 
 
809 aa  1101    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.3 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  64.95 
 
 
853 aa  961    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  65.73 
 
 
873 aa  798    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  56.99 
 
 
880 aa  868    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  58.41 
 
 
869 aa  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  58.79 
 
 
870 aa  791    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  69.85 
 
 
826 aa  1080    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  69.3 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  65.07 
 
 
853 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  68.5 
 
 
835 aa  1069    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  69.29 
 
 
829 aa  1041    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  58.15 
 
 
851 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  71.22 
 
 
830 aa  1114    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  70.35 
 
 
835 aa  1110    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  69.53 
 
 
842 aa  1079    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  70.01 
 
 
833 aa  1085    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
806 aa  1598    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  59.42 
 
 
677 aa  758    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  64.51 
 
 
822 aa  1019    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  69.29 
 
 
829 aa  1041    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 
861 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  57.52 
 
 
851 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  55.01 
 
 
850 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  58.41 
 
 
852 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.3 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  58.28 
 
 
851 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  54.92 
 
 
681 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  39.94 
 
 
783 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 
723 aa  479  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
707 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.17 
 
 
712 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
712 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
712 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  41.68 
 
 
675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 
640 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.15 
 
 
641 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  38.85 
 
 
641 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.15 
 
 
641 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  39.67 
 
 
713 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  38.85 
 
 
641 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  39.37 
 
 
641 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.15 
 
 
641 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  39.15 
 
 
641 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.54 
 
 
709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  38.85 
 
 
641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  40.37 
 
 
778 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
641 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  42.44 
 
 
735 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
641 aa  452  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  39.84 
 
 
641 aa  452  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
767 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
724 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
833 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  39.07 
 
 
802 aa  445  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
641 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
673 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  41.59 
 
 
635 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
793 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
1022 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  37.34 
 
 
812 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
800 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
800 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.41 
 
 
737 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  42.48 
 
 
639 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
750 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
726 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
750 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
720 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
712 aa  415  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.73 
 
 
771 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 
637 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
984 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
734 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
984 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 
825 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 
718 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
785 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41 
 
 
939 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
740 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
751 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
734 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
734 aa  405  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
750 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  39.94 
 
 
651 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  38.91 
 
 
731 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
868 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
750 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
768 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
750 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  37.21 
 
 
784 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
640 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  39.67 
 
 
748 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  41.84 
 
 
799 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>