More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2137 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  67.53 
 
 		 665 aa  847    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  65.07 
 
 		 806 aa  984    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  67.53 
 
 		 665 aa  847    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  54.42 
 
 		 870 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  53.56 
 
 		 850 aa  861    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  68.97 
 
 		 809 aa  1067    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  58.77 
 
 		 677 aa  745    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 		 869 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  99.3 
 
 		 853 aa  1675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  63.05 
 
 		 822 aa  1024    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  65.71 
 
 		 826 aa  1016    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 853 aa  1687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  67.53 
 
 		 665 aa  847    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  69.06 
 
 		 829 aa  1066    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  69.06 
 
 		 829 aa  1066    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  65.87 
 
 		 830 aa  1021    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  74.44 
 
 		 842 aa  1167    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  57.58 
 
 		 873 aa  884    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  71.07 
 
 		 833 aa  1107    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  67.53 
 
 		 665 aa  847    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  58.45 
 
 		 861 aa  885    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  69.74 
 
 		 835 aa  1100    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  57.57 
 
 		 851 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  69.32 
 
 		 835 aa  1110    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  70.45 
 
 		 834 aa  1106    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 		 851 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  53.9 
 
 		 852 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  57.91 
 
 		 880 aa  881    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  53.9 
 
 		 851 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  53.06 
 
 		 681 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 		 783 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.84 
 
 		 735 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  43.87 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.04 
 
 		 713 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.55 
 
 		 712 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 		 707 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  40.87 
 
 		 675 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 		 641 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 712 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 		 641 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.63 
 
 		 767 aa  452  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  40.15 
 
 		 641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  40.15 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  40.15 
 
 		 641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  40.31 
 
 		 641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.69 
 
 		 641 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.85 
 
 		 641 aa  446  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.85 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.69 
 
 		 641 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.9 
 
 		 709 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  40.15 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 1022 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 		 639 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 		 673 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 		 711 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  43 
 
 		 793 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 		 778 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  35.93 
 
 		 868 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 712 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 751 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 750 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 		 904 aa  422  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.08 
 
 		 641 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 		 800 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 651 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 		 750 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 		 737 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 		 800 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 		 738 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 		 800 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 		 734 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 		 750 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 984 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 		 748 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 984 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 		 712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 		 939 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.81 
 
 		 709 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  37.92 
 
 		 744 aa  406  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  37.91 
 
 		 709 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 		 651 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.43 
 
 		 752 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  38.32 
 
 		 768 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.29 
 
 		 799 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 710 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 710 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  38.45 
 
 		 656 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>