More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0522 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  60.25 
 
 		 675 aa  735    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 778 aa  1513    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  54.93 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  46.59 
 
 		 723 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  49.09 
 
 		 724 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 		 712 aa  512  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 		 712 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 		 712 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 		 707 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 		 783 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  41.04 
 
 		 735 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 		 641 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 		 641 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  40.4 
 
 		 641 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  40.09 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  40.4 
 
 		 641 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  40.09 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  40.09 
 
 		 641 aa  482  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  40.25 
 
 		 641 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 835 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 873 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  40.09 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  40.09 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  39.42 
 
 		 713 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  40.25 
 
 		 641 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 		 850 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 		 639 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.99 
 
 		 709 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 		 767 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 		 809 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  43.49 
 
 		 861 aa  466  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 833 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 		 852 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  44.15 
 
 		 835 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  40.49 
 
 		 806 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 		 822 aa  462  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 833 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 880 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 		 834 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 		 869 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 870 aa  459  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.55 
 
 		 641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  45.21 
 
 		 750 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 		 851 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 825 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  45.25 
 
 		 842 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 851 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 738 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 		 830 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 		 785 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 640 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  39.88 
 
 		 829 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  39.88 
 
 		 829 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 734 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 812 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  39.35 
 
 		 826 aa  442  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  44.81 
 
 		 673 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 851 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 		 793 aa  439  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.98 
 
 		 1022 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 647 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 		 635 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.4 
 
 		 751 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  44.41 
 
 		 853 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 		 750 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  44.25 
 
 		 853 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.41 
 
 		 904 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.31 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 		 750 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 		 737 aa  422  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 		 712 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 654 aa  419  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 651 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 711 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 984 aa  416  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  42.16 
 
 		 722 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  42.16 
 
 		 656 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 984 aa  416  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  43.78 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  38.23 
 
 		 709 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 800 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 		 753 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 800 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 		 637 aa  412  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3729  heavy metal translocating P-type ATPase  45.14 
 
 		 675 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  45.96 
 
 		 656 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  36.61 
 
 		 738 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  43.51 
 
 		 656 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  37.76 
 
 		 750 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 		 655 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  34.76 
 
 		 791 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  36.19 
 
 		 926 aa  409  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 		 799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>