More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2654 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  62.61 
 
 
710 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3097  heavy metal translocating P-type ATPase  65.42 
 
 
670 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0656722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
654 aa  1243    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  78.4 
 
 
655 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  75.44 
 
 
656 aa  881    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2831  heavy metal translocating P-type ATPase  63.36 
 
 
705 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  78.4 
 
 
655 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0776  heavy metal translocating P-type ATPase  57.55 
 
 
630 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634796  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12024  metal cation transporter P-type ATPase G ctpG  71.97 
 
 
771 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.350952  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  77.78 
 
 
656 aa  912    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  63.1 
 
 
712 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  62.99 
 
 
723 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.724318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  77.8 
 
 
652 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  78.92 
 
 
651 aa  952    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  79.56 
 
 
655 aa  959    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  71.38 
 
 
651 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4476  heavy metal translocating P-type ATPase  70.38 
 
 
650 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  70.38 
 
 
650 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4207  heavy metal translocating P-type ATPase  70.38 
 
 
650 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1792  heavy metal translocating P-type ATPase  64.94 
 
 
722 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0266735  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  77.48 
 
 
652 aa  899    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2207  heavy metal translocating P-type ATPase  76.18 
 
 
656 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  62.61 
 
 
710 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  78.68 
 
 
655 aa  933    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1493  heavy metal translocating P-type ATPase  62.99 
 
 
723 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0505  heavy metal translocating P-type ATPase  74.92 
 
 
660 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  77.05 
 
 
655 aa  932    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  77.66 
 
 
656 aa  961    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  62.61 
 
 
710 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5411  heavy metal translocating P-type ATPase  74.92 
 
 
660 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.043648 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5391  heavy metal translocating P-type ATPase  74.92 
 
 
660 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22910  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  55.5 
 
 
637 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  57.47 
 
 
679 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11850  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  55.67 
 
 
678 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  45.57 
 
 
635 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
712 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
712 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.25 
 
 
637 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  39.62 
 
 
712 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
767 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.82 
 
 
709 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
783 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.7 
 
 
870 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
869 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  43.46 
 
 
851 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
851 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  43.31 
 
 
852 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 
723 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
707 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 
718 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.08 
 
 
738 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
713 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
647 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  43.34 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
826 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  43.34 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
873 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
904 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
850 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  43.38 
 
 
639 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
800 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
673 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
851 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
750 aa  399  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
640 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
800 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
751 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
800 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
738 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
793 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40 
 
 
773 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
681 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
737 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
835 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
778 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
822 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  39.48 
 
 
748 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
825 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
768 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
701 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
724 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
799 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.09 
 
 
712 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
726 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
799 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 
861 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
785 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
812 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  38.8 
 
 
830 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  44.75 
 
 
1022 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
833 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
800 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
800 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
835 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
675 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
809 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
734 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  41.19 
 
 
735 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
984 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
722 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>