More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0055 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 665 aa  1325    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 806 aa  848    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  68.39 
 
 		 834 aa  859    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 665 aa  1325    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  61.12 
 
 		 873 aa  758    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  61.14 
 
 		 861 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  59.16 
 
 		 880 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  68.13 
 
 		 853 aa  811    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  68.18 
 
 		 826 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  67.41 
 
 		 835 aa  873    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  67.98 
 
 		 853 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 665 aa  1325    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  69.45 
 
 		 829 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  58.56 
 
 		 850 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 		 830 aa  859    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  70.13 
 
 		 833 aa  887    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  61.01 
 
 		 870 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 665 aa  1325    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  72.59 
 
 		 835 aa  933    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  60.58 
 
 		 851 aa  710    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  61.21 
 
 		 869 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  69.04 
 
 		 809 aa  890    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 829 aa  840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  69.48 
 
 		 842 aa  861    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  61.21 
 
 		 851 aa  721    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  58.86 
 
 		 677 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  68.5 
 
 		 822 aa  900    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  61.21 
 
 		 851 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  61.36 
 
 		 852 aa  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  52.19 
 
 		 681 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 		 707 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 		 712 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.05 
 
 		 712 aa  475  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.41 
 
 		 783 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 		 767 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.79 
 
 		 713 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.23 
 
 		 709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 675 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.69 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.5 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  42.32 
 
 		 673 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.19 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  38.88 
 
 		 641 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  38.88 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  38.88 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  38.88 
 
 		 641 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.04 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 		 737 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  38.72 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 		 833 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 		 723 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  43.31 
 
 		 778 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.25 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.88 
 
 		 751 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 		 1022 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  38.57 
 
 		 641 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 		 639 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 		 635 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.45 
 
 		 812 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.67 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 984 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 		 793 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 984 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  41.44 
 
 		 724 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.02 
 
 		 769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 		 800 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 		 800 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 		 939 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 		 647 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 		 799 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 718 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 		 637 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  43.8 
 
 		 712 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 904 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 		 748 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  41.13 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 		 740 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 868 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 		 785 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 738 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 		 800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 		 744 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 		 800 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 		 750 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 		 800 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 750 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 711 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  39.32 
 
 		 794 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 713 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 926 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 		 791 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>