More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5970 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  58.08 
 
 		 880 aa  899    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 665 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  55.47 
 
 		 852 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  70.12 
 
 		 809 aa  1112    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  72.34 
 
 		 835 aa  1167    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  72.3 
 
 		 834 aa  1149    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 665 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  59.22 
 
 		 861 aa  909    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 829 aa  1647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  67.63 
 
 		 826 aa  1063    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  55.6 
 
 		 851 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  54.75 
 
 		 850 aa  876    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  69.06 
 
 		 853 aa  1060    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 665 aa  872    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  100 
 
 		 829 aa  1647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  65.02 
 
 		 822 aa  1052    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  66.95 
 
 		 830 aa  1043    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  73.63 
 
 		 842 aa  1172    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  70.16 
 
 		 835 aa  1141    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  70.04 
 
 		 833 aa  1110    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  55.47 
 
 		 869 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  56.24 
 
 		 873 aa  887    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  54.89 
 
 		 870 aa  758    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 		 851 aa  830    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  69.45 
 
 		 665 aa  872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  55.6 
 
 		 851 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  69.29 
 
 		 806 aa  1065    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  69.3 
 
 		 853 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  59.64 
 
 		 677 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  56.8 
 
 		 681 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 		 783 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.28 
 
 		 707 aa  492  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 712 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.67 
 
 		 712 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 		 712 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 		 767 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  41.29 
 
 		 641 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.01 
 
 		 735 aa  475  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 713 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  41.7 
 
 		 675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  43.56 
 
 		 640 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 641 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.6 
 
 		 709 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 723 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 		 641 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 		 641 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 		 641 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  43.49 
 
 		 635 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.87 
 
 		 641 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 641 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 		 641 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.91 
 
 		 833 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.72 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  40.35 
 
 		 641 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  39.72 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 673 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 		 793 aa  442  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  39.42 
 
 		 641 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  42.48 
 
 		 1022 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 		 637 aa  438  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  39.88 
 
 		 778 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 		 651 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 		 802 aa  432  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 718 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.78 
 
 		 737 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 712 aa  425  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 		 656 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 904 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.27 
 
 		 751 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 		 984 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 711 aa  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 		 825 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 		 984 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 		 734 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 726 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  39.82 
 
 		 764 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 655 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 		 651 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.42 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  38.25 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.8 
 
 		 812 aa  411  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 868 aa  412  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 		 750 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 		 748 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  40.8 
 
 		 740 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 734 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 		 710 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 		 710 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 		 710 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 750 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  41.17 
 
 		 639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.85 
 
 		 787 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 		 731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>