More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3297 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1198  cadmium-translocating P-type ATPase  64.66 
 
 
646 aa  718    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.08554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  72.21 
 
 
665 aa  844    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.381372  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1476  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  69.68 
 
 
647 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1100  cadmium-translocating P-type ATPase  64.82 
 
 
646 aa  721    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3184  hypothetical protein  67.89 
 
 
636 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3297  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
646 aa  1241    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00745206  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0127  heavy metal translocating P-type ATPase  69.52 
 
 
647 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  46.84 
 
 
640 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  46.85 
 
 
640 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
723 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
675 aa  425  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
724 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  41.29 
 
 
641 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  40.03 
 
 
641 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 
635 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  40.1 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.76 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  39.93 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  40.1 
 
 
641 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  39.76 
 
 
641 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41 
 
 
641 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.76 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
713 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.93 
 
 
641 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.97 
 
 
850 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.84 
 
 
834 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
835 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  40.1 
 
 
641 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.95 
 
 
751 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
639 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
783 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
665 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
665 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
665 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
665 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 
711 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
737 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 
740 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
814 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
712 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
712 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
880 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  39.88 
 
 
833 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
822 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
844 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
835 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
712 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  46.07 
 
 
778 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  39.8 
 
 
647 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
712 aa  379  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
851 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  42.74 
 
 
704 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
718 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
744 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
677 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  42.43 
 
 
720 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
681 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
809 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
833 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  42.57 
 
 
873 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  43.34 
 
 
716 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.63 
 
 
984 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.63 
 
 
984 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  42.41 
 
 
1022 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.67 
 
 
707 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  40.81 
 
 
678 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
861 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.13 
 
 
767 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
826 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.81 
 
 
904 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
726 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
673 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
799 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.14 
 
 
738 aa  365  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
852 aa  364  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  42.69 
 
 
851 aa  364  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  41.89 
 
 
869 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  41.89 
 
 
851 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.61 
 
 
709 aa  362  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
870 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
830 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
800 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
800 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
812 aa  359  7e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  34.78 
 
 
788 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 
939 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  40.31 
 
 
842 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
868 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  34.5 
 
 
788 aa  357  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  34.62 
 
 
788 aa  357  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  42.96 
 
 
764 aa  356  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  40 
 
 
799 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
713 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  34.5 
 
 
788 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
800 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
806 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  39.24 
 
 
735 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
750 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  34.45 
 
 
788 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>