More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1198 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1198  cadmium-translocating P-type ATPase  100 
 
 
646 aa  1281    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.08554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  65.45 
 
 
665 aa  721    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.381372  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0127  heavy metal translocating P-type ATPase  64.41 
 
 
647 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1476  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  64.72 
 
 
647 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1100  cadmium-translocating P-type ATPase  99.69 
 
 
646 aa  1277    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3297  heavy metal translocating P-type ATPase  64.66 
 
 
646 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00745206  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3184  hypothetical protein  64.15 
 
 
636 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
640 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 
723 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
724 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
675 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.17 
 
 
641 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
639 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.35 
 
 
850 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
641 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
647 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  37.39 
 
 
641 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  37.39 
 
 
641 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  37.39 
 
 
641 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  37.39 
 
 
641 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  37.12 
 
 
641 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
665 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  37.23 
 
 
641 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  37.39 
 
 
641 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
641 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
665 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  37.23 
 
 
641 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
778 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
665 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
665 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  37.23 
 
 
641 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
783 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
880 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.7 
 
 
735 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
814 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
677 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
834 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
835 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
740 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  41.19 
 
 
851 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
704 aa  363  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 
851 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.15 
 
 
713 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
712 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.94 
 
 
712 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
869 aa  362  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
851 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
806 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 
833 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  39.46 
 
 
826 aa  360  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
635 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
873 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 
822 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  42.78 
 
 
802 aa  353  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
753 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
751 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 
744 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  41.23 
 
 
852 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
835 aa  353  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  39.26 
 
 
678 aa  351  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
809 aa  350  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.87 
 
 
833 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
861 aa  350  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
734 aa  349  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  41.62 
 
 
870 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
984 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
984 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
681 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
844 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
830 aa  346  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  40.44 
 
 
764 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
738 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
720 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
750 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
716 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
707 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
939 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
750 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.05 
 
 
1022 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
712 aa  339  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
750 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
750 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 
750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
718 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
673 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
785 aa  336  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
793 aa  336  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
767 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
734 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  38.64 
 
 
842 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  35.06 
 
 
788 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.34 
 
 
709 aa  333  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
731 aa  334  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  35.06 
 
 
788 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  39.59 
 
 
713 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
739 aa  333  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  34.75 
 
 
788 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 
738 aa  333  6e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>