More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1476 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1198  cadmium-translocating P-type ATPase  64.72 
 
 		 646 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.08554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  67.72 
 
 		 665 aa  725    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.381372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1476  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 647 aa  1231    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3184  hypothetical protein  80.79 
 
 		 636 aa  931    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0127  heavy metal translocating P-type ATPase  99.23 
 
 		 647 aa  1222    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1100  cadmium-translocating P-type ATPase  64.88 
 
 		 646 aa  709    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3297  heavy metal translocating P-type ATPase  69.68 
 
 		 646 aa  743    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00745206  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 640 aa  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  45.34 
 
 		 640 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.65 
 
 		 641 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.8 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 		 723 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 712 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  39.8 
 
 		 712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  41.91 
 
 		 675 aa  403  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 783 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 707 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  47.77 
 
 		 778 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  44.52 
 
 		 639 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  45.08 
 
 		 869 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  38.22 
 
 		 641 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  38.27 
 
 		 641 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  42.78 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 833 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  45.08 
 
 		 851 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 		 851 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  45.08 
 
 		 851 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.88 
 
 		 713 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  38.22 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  38.22 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  38.05 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  38.05 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  38.05 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.68 
 
 		 641 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 		 880 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.23 
 
 		 681 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  45.08 
 
 		 852 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  44.92 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  38.05 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.65 
 
 		 751 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  43.5 
 
 		 724 aa  389  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 844 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  38.34 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 744 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 712 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 		 737 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 704 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 		 834 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 		 711 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.49 
 
 		 735 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.44 
 
 		 709 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 		 673 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 		 822 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  43 
 
 		 806 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 734 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  40.17 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  41.95 
 
 		 873 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 850 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 		 712 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 861 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 826 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 740 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 830 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  42.83 
 
 		 842 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  41.85 
 
 		 713 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 709 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  39.69 
 
 		 799 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 793 aa  363  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 		 658 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 835 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 984 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 984 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 718 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 		 767 aa  360  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 		 904 aa  359  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05940  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.15 
 
 		 638 aa  359  9e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.558589 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.31 
 
 		 785 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 726 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.23 
 
 		 738 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  39.4 
 
 		 799 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 800 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 		 825 aa  356  5.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 716 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 		 812 aa  355  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 		 1022 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 800 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 800 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  39 
 
 		 799 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 		 939 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>