More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3177 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  77.18 
 
 
392 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  83.21 
 
 
393 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  83.72 
 
 
393 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  83.46 
 
 
393 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  87.02 
 
 
393 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  71.1 
 
 
403 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  70.26 
 
 
406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  69.31 
 
 
396 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  72.75 
 
 
402 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  72.75 
 
 
402 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  72.75 
 
 
402 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  69.82 
 
 
399 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  72.49 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  72.49 
 
 
402 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  72.49 
 
 
402 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  69.81 
 
 
371 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  63.57 
 
 
419 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  61.42 
 
 
395 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  61.04 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  52.21 
 
 
389 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  47.93 
 
 
392 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  46.63 
 
 
392 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  45.85 
 
 
393 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  47.44 
 
 
392 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  42.71 
 
 
393 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  43.22 
 
 
397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  33.17 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  31.42 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  30.5 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  30.45 
 
 
434 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  31.9 
 
 
394 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  31.79 
 
 
397 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  29.07 
 
 
414 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  32.05 
 
 
394 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  30.25 
 
 
403 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  31.54 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  28.57 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  32.26 
 
 
388 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  29.74 
 
 
398 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  28.42 
 
 
383 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  26.28 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  26.28 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  25.77 
 
 
383 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  24.03 
 
 
437 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  26.72 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  27.81 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  27.49 
 
 
383 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  28.35 
 
 
383 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  27.46 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  27.51 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  27.07 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  27.46 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
461 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.46 
 
 
370 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.6 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.1 
 
 
367 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.34 
 
 
348 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.76 
 
 
369 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.77 
 
 
384 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  25.69 
 
 
410 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  25.19 
 
 
380 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  25.19 
 
 
380 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.59 
 
 
448 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.54 
 
 
357 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.48 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  24.08 
 
 
378 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.16 
 
 
358 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  23.82 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  23.74 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23.16 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.61 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.16 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.19 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.46 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.16 
 
 
365 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.9 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.16 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  24.68 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  24.18 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  21.33 
 
 
351 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.06 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  25 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  25.32 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  24.04 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  23.12 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  24.48 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.8 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  26.29 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.07 
 
 
359 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  25.44 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.46 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.32 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>