18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3180 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  33.7 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  36.03 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  31.42 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  31.2 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  30.09 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  33.19 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  31.12 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  25.21 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1240  hypothetical protein  28.28 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  25.99 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1904  hypothetical protein  28.71 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.815763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  21.68 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  23.62 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  23.88 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>