More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3147 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  82.24 
 
 
152 aa  260  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  82.24 
 
 
152 aa  260  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.8 
 
 
153 aa  218  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  66.44 
 
 
154 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  64.24 
 
 
154 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.18 
 
 
152 aa  212  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2917  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.33 
 
 
153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.33 
 
 
153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.12 
 
 
164 aa  210  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  66 
 
 
151 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.91 
 
 
152 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.51 
 
 
153 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.84 
 
 
153 aa  207  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.51 
 
 
153 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.84 
 
 
153 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  62.84 
 
 
153 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  63.76 
 
 
153 aa  206  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  64 
 
 
151 aa  206  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.51 
 
 
153 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  62.16 
 
 
153 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.47 
 
 
152 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  63.09 
 
 
153 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  63.09 
 
 
153 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  63.09 
 
 
153 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.33 
 
 
151 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.33 
 
 
151 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.42 
 
 
153 aa  204  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.86 
 
 
157 aa  203  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  64.24 
 
 
152 aa  201  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  62.91 
 
 
152 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.44 
 
 
163 aa  200  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_003296  RS05442  dehydrogenase, small chain oxidoreductase protein  64.24 
 
 
152 aa  199  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.094889  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
151 aa  199  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.5 
 
 
187 aa  199  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.67 
 
 
151 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  64.24 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.84 
 
 
153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4805  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.25 
 
 
152 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.875575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  59.6 
 
 
152 aa  196  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3728  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.25 
 
 
152 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.24 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  62.84 
 
 
151 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.58 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.86 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  61.59 
 
 
152 aa  194  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.18 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.76 
 
 
188 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  63.27 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.55 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  61.84 
 
 
153 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.95 
 
 
159 aa  193  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  59.6 
 
 
152 aa  193  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  61.49 
 
 
153 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
153 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
153 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
153 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.86 
 
 
159 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.14 
 
 
163 aa  191  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  60.81 
 
 
153 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.26 
 
 
154 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.81 
 
 
153 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.18 
 
 
161 aa  190  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.18 
 
 
161 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3405  putative oxidoreductase  63.76 
 
 
153 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  62.14 
 
 
153 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.59 
 
 
153 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  59.87 
 
 
153 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  55.92 
 
 
155 aa  188  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  59.87 
 
 
152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  62.42 
 
 
154 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.74 
 
 
167 aa  186  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
148 aa  186  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  58.94 
 
 
152 aa  186  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  59.6 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  55.33 
 
 
168 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
153 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  60.4 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
159 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.86 
 
 
159 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  57.24 
 
 
156 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.18 
 
 
157 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.4 
 
 
158 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  61.9 
 
 
167 aa  185  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  56.58 
 
 
156 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
151 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
151 aa  184  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
152 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>