More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2733 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2733  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 432 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2027  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  68.56 
 
 		 406 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2895  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.07 
 
 		 382 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0840  putative decarboxylase, pyridoxal-dependent  40.49 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0731  ornithine decarboxylase  40.49 
 
 		 400 aa  243  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0258  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.04 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  40.87 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1197  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.9 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4664  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.05 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.634259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1794  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.89 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1991  putative ornithine decarboxylase  37.67 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0701  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.4 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.73 
 
 		 381 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.53 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2547  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.91 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.211268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.68 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.68 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.91 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.17 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  31.13 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.03 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.29 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.4 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.44 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.02 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  32.3 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.28 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.19 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  33.07 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  33.07 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  31.96 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  31.44 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.19 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  29.38 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.55 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.2 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.88 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.97 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.87 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.61 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  30.83 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.89 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  30.19 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  32.47 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.01 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.02 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.69 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  31.71 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  29.95 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  28.28 
 
 		 527 aa  113  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  32.61 
 
 		 389 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  29.69 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  29.69 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.61 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  26.53 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.25 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  28.69 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  28.65 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  27.59 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  29.43 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  29.93 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.59 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  26.7 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  31.83 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  29.86 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  27.84 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.3 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  29.69 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  27.09 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  27.09 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31322  Ornithine decarboxylase  27.6 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0025491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  28.61 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  28.61 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2875  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  27.39 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  27.04 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  26.83 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.68 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  27.91 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  26.72 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  25.58 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  26.52 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  28.15 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_2834  predicted protein  24.87 
 
 		 392 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.82 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  27.49 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  26.56 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  26.9 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  25.84 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  27.61 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  26.3 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  26.3 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  26.3 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  26.3 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  25.52 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>