More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01333 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  76.05 
 
 
528 aa  805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  74.33 
 
 
527 aa  763    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  93.01 
 
 
529 aa  978    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1060    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  53.15 
 
 
553 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  52.58 
 
 
559 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  51.72 
 
 
542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  52.01 
 
 
544 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  51.9 
 
 
541 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  51.5 
 
 
556 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  51.62 
 
 
535 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  51.63 
 
 
547 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 
552 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  51.52 
 
 
545 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  51.33 
 
 
545 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  50.95 
 
 
547 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 
551 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 
551 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  50.67 
 
 
551 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 
551 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  51.9 
 
 
547 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  46.62 
 
 
534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 
528 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  46.56 
 
 
542 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  46.14 
 
 
535 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  44.79 
 
 
531 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.22 
 
 
524 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 
523 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.27 
 
 
545 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 
520 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
595 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
558 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
546 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 
575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  31.01 
 
 
720 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
562 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 
565 aa  127  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
551 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
572 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
566 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
567 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 
561 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.46 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  25.52 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.65 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  27.14 
 
 
572 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  25.52 
 
 
564 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
567 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 
572 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 
547 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 
547 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
598 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  26.38 
 
 
561 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  23.95 
 
 
574 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  24.83 
 
 
583 aa  110  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.95 
 
 
539 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 
561 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.09 
 
 
592 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.13 
 
 
556 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  25.19 
 
 
567 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.39 
 
 
585 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  25.91 
 
 
541 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  25 
 
 
575 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 
606 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.04 
 
 
649 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  24.77 
 
 
568 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 
584 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  25.88 
 
 
585 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 
606 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.49 
 
 
588 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  23.83 
 
 
566 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 
574 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.52 
 
 
563 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
679 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 
567 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 
571 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  24.76 
 
 
558 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  24.91 
 
 
682 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  25.38 
 
 
615 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 
566 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.28 
 
 
555 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  23.95 
 
 
576 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
577 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 
667 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 
581 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 
665 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 
665 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.78 
 
 
617 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.23 
 
 
540 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
585 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
566 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  25.14 
 
 
566 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.41 
 
 
662 aa  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  22.82 
 
 
566 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 
652 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27.08 
 
 
564 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  25.56 
 
 
619 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>