More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0828 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  100 
 
 		 527 aa  1045    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  70.4 
 
 		 528 aa  747    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  74.33 
 
 		 529 aa  764    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  75.1 
 
 		 529 aa  791    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  55.45 
 
 		 553 aa  549  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  52.19 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  50.67 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 		 542 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  51.82 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 		 547 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  51.63 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  52 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  51.81 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  51.63 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  51.63 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  50.1 
 
 		 552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  51.43 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  48.08 
 
 		 534 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  46.46 
 
 		 528 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  44.66 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  44.68 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.64 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  41.14 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  47.06 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  39.77 
 
 		 520 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 541 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 		 595 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 565 aa  125  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 558 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.27 
 
 		 562 aa  123  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.27 
 
 		 588 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  25.76 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  24.91 
 
 		 541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 572 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  26.74 
 
 		 569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 561 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 665 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 665 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 575 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 		 548 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  25.94 
 
 		 561 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  23.86 
 
 		 567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  25.38 
 
 		 558 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 		 598 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  25.04 
 
 		 567 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 606 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 631 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.04 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  24.89 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.28 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 565 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  25.51 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 577 aa  107  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  23.49 
 
 		 568 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.1 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.56 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.84 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  24.77 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 		 572 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.84 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  24.16 
 
 		 572 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  25 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  25.45 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 		 567 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  25.23 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.77 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  24.3 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  26.12 
 
 		 615 aa  104  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.05 
 
 		 539 aa  104  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 566 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  25.4 
 
 		 564 aa  103  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  24.77 
 
 		 558 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  25.61 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>