More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0513 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  100 
 
 		 528 aa  1056    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  76.05 
 
 		 529 aa  802    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  76.05 
 
 		 529 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  70.4 
 
 		 527 aa  733    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.44 
 
 		 553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  50.1 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  50.85 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  50.67 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  49.9 
 
 		 544 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  50.94 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  48.67 
 
 		 541 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  50.94 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  50.95 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  50.48 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  50.48 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  50.48 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  50.48 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  50.76 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  49.71 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 		 534 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  43.98 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  45.79 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  44.32 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.45 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  40.76 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.78 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  41.22 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.08 
 
 		 562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 558 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  27.95 
 
 		 561 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  27.03 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 		 595 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.03 
 
 		 561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 551 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 584 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 561 aa  123  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 598 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  25.32 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  26.08 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 667 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  26.5 
 
 		 567 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  27.02 
 
 		 563 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  25.28 
 
 		 566 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.91 
 
 		 720 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.98 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  24.96 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.13 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  26.23 
 
 		 558 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  26.56 
 
 		 585 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.7 
 
 		 575 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  23.96 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.77 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  22.87 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  23.11 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.74 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 662 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27.65 
 
 		 564 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.86 
 
 		 567 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 595 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  25.32 
 
 		 575 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  26.79 
 
 		 562 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.78 
 
 		 539 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  23.06 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  26.55 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 572 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 		 567 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  25.46 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  26.05 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  23.98 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  25.26 
 
 		 564 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  26.71 
 
 		 607 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  26.41 
 
 		 569 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  25.47 
 
 		 631 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  27.47 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>