More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1189 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 534 aa  1058    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  51.98 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  49.43 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  47.19 
 
 		 553 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  49.9 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  47.9 
 
 		 544 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  49.22 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  47.59 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  51.08 
 
 		 552 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  49.9 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  50.19 
 
 		 551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  50.49 
 
 		 547 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.21 
 
 		 528 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.31 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  49.15 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  46.32 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  48.96 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  49.14 
 
 		 547 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  46.41 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  45.49 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  44.96 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  42.58 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.75 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  43.15 
 
 		 523 aa  343  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  47.01 
 
 		 545 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40.66 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.58 
 
 		 601 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.58 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.58 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.58 
 
 		 601 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.58 
 
 		 601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 558 aa  134  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.87 
 
 		 601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 		 661 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  29.45 
 
 		 661 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  27.96 
 
 		 650 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.55 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.29 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 548 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  28.19 
 
 		 649 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  27.31 
 
 		 628 aa  124  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.27 
 
 		 602 aa  124  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  28.68 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  26.9 
 
 		 620 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 566 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.18 
 
 		 648 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.98 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  27.13 
 
 		 541 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 566 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  27.12 
 
 		 628 aa  120  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.77 
 
 		 620 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.88 
 
 		 620 aa  120  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.73 
 
 		 649 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  26.92 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  26.97 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  27.73 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.59 
 
 		 648 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 589 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.16 
 
 		 621 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.59 
 
 		 648 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  27.59 
 
 		 648 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 		 620 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 		 620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.71 
 
 		 540 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.7 
 
 		 604 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.73 
 
 		 617 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  27.9 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  25.96 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  28.46 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  26.24 
 
 		 624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  25.75 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  26.33 
 
 		 563 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.55 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 672 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.55 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>