More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2640 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  74.29 
 
 
531 aa  770    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
535 aa  1058    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  48.65 
 
 
535 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  47.98 
 
 
551 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  47.98 
 
 
551 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  46.54 
 
 
559 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  47.98 
 
 
551 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  47.98 
 
 
551 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  46.82 
 
 
544 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 
547 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  47.5 
 
 
556 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.81 
 
 
553 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  47.4 
 
 
545 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  46.21 
 
 
542 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  45.49 
 
 
534 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 
542 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 
545 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 
547 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
541 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  46.82 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.05 
 
 
529 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  42.16 
 
 
528 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  46.73 
 
 
552 aa  412  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  46.14 
 
 
529 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  45.68 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.88 
 
 
524 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.3 
 
 
528 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  43.45 
 
 
523 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  46.92 
 
 
545 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 
520 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  28.91 
 
 
561 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  28.78 
 
 
561 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  28.1 
 
 
562 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  29.06 
 
 
589 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  28.91 
 
 
563 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  29.52 
 
 
589 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  28.87 
 
 
589 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  28.55 
 
 
561 aa  134  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.68 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  29.06 
 
 
589 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.32 
 
 
543 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.67 
 
 
608 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.32 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 
565 aa  127  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 
566 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  28.16 
 
 
589 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
566 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.32 
 
 
563 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.09 
 
 
566 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  28.82 
 
 
660 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.56 
 
 
585 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  31.9 
 
 
599 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0617  sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 
571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  28.28 
 
 
558 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.19 
 
 
617 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.32 
 
 
562 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  27.92 
 
 
558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  27.29 
 
 
589 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  27.81 
 
 
589 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  24.72 
 
 
662 aa  120  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  27.47 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  26.93 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  27.47 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.06 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  27.47 
 
 
558 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
659 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 
660 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 
546 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  27.05 
 
 
664 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 
649 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.82 
 
 
621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  28.08 
 
 
628 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.39 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.34 
 
 
572 aa  115  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
674 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
558 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  28.36 
 
 
598 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.42 
 
 
620 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.42 
 
 
620 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.13 
 
 
620 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.42 
 
 
620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
659 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  27.64 
 
 
628 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.42 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.42 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  25.81 
 
 
568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.97 
 
 
620 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.97 
 
 
620 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>